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小羅碎碎念
項(xiàng)目復(fù)現(xiàn)
今天和大家分享一個(gè)非常具有參考價(jià)值的項(xiàng)目,手把手帶著大家復(fù)現(xiàn)一篇發(fā)表在柳葉刀數(shù)字健康的文章。
花了六個(gè)小時(shí)才完成的這篇推送,信息量非常大,遇到了很多報(bào)錯(cuò)問(wèn)題,但是解決以后的感覺(jué)是非常爽的,先給大家展示一下最終的成果——在同一張切片上,通過(guò)四張熱圖,展示子宮內(nèi)膜癌四種分子分型的區(qū)分標(biāo)準(zhǔn)。
只要你跟著我的教程走,你也能一比一復(fù)現(xiàn)結(jié)果,并且完整理解作者的思路,同時(shí)把代碼遷移到自己項(xiàng)目里!
除了完成分子分型任務(wù),作者的代碼中還有一個(gè)非常值得借鑒的——對(duì)WSI進(jìn)行下采樣,從而減小硬件壓力,同時(shí)一定程度緩解數(shù)據(jù)不平衡的現(xiàn)象。
我們可以通過(guò)生成質(zhì)量控制縮略圖,來(lái)評(píng)估采樣的patches是否能代表切片的主要部分。